Fen Fakültesi tarihçesi 26.09.1963 gün ve 337 sayılı Kanun ile Ankara Üniversitesine bağlı ikinci bir Tıp Fakültesinin “Hacettepe Tıp ve Sağlık Bilimleri Fakültesi”nin kuruluşuna dayanır.

23.08.1971 tarihinde Mühendislik Fakültesi ve Fen Fakültesi olarak iki Fakülteye bölünmesiyle Fakültemiz kurulmuştur. 

Biyoloji, İstatistik ve Matematik Bölümlerine 1992 yılında Kimya Bölümü, 2002 yılında ise Aktüerya Bilimleri Bölümü eklenerek Fakültemiz günümüzdeki yapısına ulaşmıştır.